Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRN4Q8WUT4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRN4Q8WUT4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms