Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC150Q8NCX0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC150Q8NCX0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC150Q8NCX0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC150Q8NCX0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC150Q8NCX0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC150Q8NCX0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC150Q8NCX0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC150Q8NCX0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms