Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U2

TMEM61, Transmembrane protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM61Q8N0U2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM61Q8N0U2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMEM61Q8N0U2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms