Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2R9

SSBP3-AS1, Putative uncharacterized protein SSBP3-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSBP3-AS1Q7Z2R9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms