Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MED13LQ71F56 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms