Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms