Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
B4GALNT3Q6L9W6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4GALNT3Q6L9W6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4GALNT3Q6L9W6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4GALNT3Q6L9W6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4GALNT3Q6L9W6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4GALNT3Q6L9W6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4GALNT3Q6L9W6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B4GALNT3Q6L9W6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms