Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SDE2Q6IQ49 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms