Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TMEM78Q5T7P6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TMEM78Q5T7P6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms