Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AKAP4Q5JQC9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms