Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDLIM3Q53GG5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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