Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRADDQ15628 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRADDQ15628 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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