Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SQLEQ14534 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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