Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CAMK2BQ13554 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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