Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XRCC4Q13426 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms