Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP4Q13115 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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