Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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