Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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