Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GRIN2AQ12879 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GRIN2AQ12879 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
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