Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CGNL1Q0VF96 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGNL1Q0VF96 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms