Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PUDPQ08623 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PUDPQ08623 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms