Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms