Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms