Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms