Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BNC1Q01954 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms