Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms