Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms