Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MPP1Q00013 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms