Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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FAM3AP98173 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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FAM3AP98173 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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FAM3AP98173 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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FAM3AP98173 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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