Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUP107P57740 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms