Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LUMP51884 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LUMP51884 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LUMP51884 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms