Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms