Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms