Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKARP32238 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKARP32238 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKARP32238 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKARP32238 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCKARP32238 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCKARP32238 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCKARP32238 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms