Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms