Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5AP29375 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5AP29375 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5AP29375 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5AP29375 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5AP29375 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM5AP29375 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms