Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms