Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNB3P16520 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB3P16520 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB3P16520 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GNB3P16520 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GNB3P16520 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB3P16520 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB3P16520 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB3P16520 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB3P16520 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB3P16520 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB3P16520 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GNB3P16520 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms