Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDH1P12830 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDH1P12830 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDH1P12830 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms