Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GLI2P10070 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GLI2P10070 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GLI2P10070 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GLI2P10070 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GLI2P10070 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms