Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFLP07196 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEFLP07196 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEFLP07196 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEFLP07196 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms