Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRB1P04280 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRB1P04280 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRB1P04280 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms