Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT7O43581 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT7O43581 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT7O43581 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms