Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms