Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRTO14522 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
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