Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
B4DGG1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
B4DGG1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
B4DGG1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
B4DGG1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms