Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPBD1B2RD01 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms