Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C5orf60A6NFR6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms