Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSDA5PKW4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms