Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD2APQ9Y5K6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms